胡麻SUC基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析
作者：齊燕妮; 李聞娟; 王利民; 趙瑋; 黨照; 謝亞萍; 張建平 甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所; 甘肅蘭州730070
摘要：利用多個物種的SUC基因蛋白序列在胡麻基因組內(nèi)進行BlastP分析,通過Pfam確認結(jié)構(gòu)域,獲得胡麻SUC基因家族成員,并進行基因結(jié)構(gòu)分析;對蛋白分子量、等電點、信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、糖基化修飾位點、亞細胞定位、Motif及二級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測。結(jié)果鑒定得到12個胡麻SUC基因家族成員,大部分成員含有4個以上的外顯子,10個以上跨膜結(jié)構(gòu)域,并獲4個特征性Motif。進化樹分析顯示,胡麻SUC分別屬于SUT1、SUT2和SUT4家族。
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