摘要:為了了解海南地方豬TLR4基因的多態(tài)性,試驗(yàn)采用PCR技術(shù)對(duì)五指山豬、臨高豬和屯昌豬的TLR4基因組序列進(jìn)行了克隆、測(cè)序,應(yīng)用DNAStar和BioEdit軟件分析其序列,SMART、SOPMA、SWISS-MODEL在線軟件分析TLR4蛋白的結(jié)構(gòu),并預(yù)測(cè)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明:獲得的三個(gè)品種海南地方豬TLR4基因DNA序列全長(zhǎng)均為10 435 bp,其中編碼區(qū)長(zhǎng)2 526 bp,編碼841個(gè)氨基酸。三個(gè)品種豬TLR4基因序列種內(nèi)比對(duì)時(shí),五指山豬在種內(nèi)有1個(gè)核苷酸位點(diǎn)存在多態(tài)性;屯昌豬在種內(nèi)有6個(gè)核苷酸位點(diǎn)存在多態(tài)性,2處位于編碼區(qū);臨高豬在種內(nèi)有3個(gè)核苷酸位點(diǎn)存在多態(tài)性,1處位于編碼區(qū)。三個(gè)品種豬TLR4基因序列種間比對(duì)時(shí),有27個(gè)核苷酸位點(diǎn)存在多態(tài)性,其中2個(gè)為錯(cuò)義突變,導(dǎo)致氨基酸改變。三個(gè)品種豬的TLR4基因序列的同源性在99.8%~99.9%之間,高度保守。海南豬TLR4基因在7 209位點(diǎn)的G→T突變和7 781位點(diǎn)的G→A位點(diǎn)突變引起了TLR4蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變。說明海南地方豬TLR4基因存在多態(tài)性,并且其多態(tài)性引起的結(jié)構(gòu)改變可能使TLR4基因功能發(fā)生變化。
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國(guó)際刊號(hào):2096-7586
國(guó)內(nèi)刊號(hào):42-1907/C