牛源cathelicidin類抗菌肽的生物信息學(xué)分析

作者:李杰; 杭柏林; 寧春妹; 司素錦; 張慧輝; 胡建和 河南省新鄉(xiāng)市農(nóng)業(yè)農(nóng)村局; 河南新鄉(xiāng)453003; 河南科技學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院; 河南新鄉(xiāng)453003

摘要:為研究牛源cathelicidin類抗菌肽的生物學(xué)功能,通過生物信息學(xué)方法對(duì)牛源cathelicidin類抗菌肽的理化性質(zhì)、信號(hào)肽、跨膜區(qū)、亞細(xì)胞定位、二級(jí)結(jié)構(gòu)和化學(xué)修飾等進(jìn)行預(yù)測(cè)分析.結(jié)果表明:牛源cathelicidin類抗菌肽為陽離子型抗菌肽,等電點(diǎn)11.53~13.20;除了BMAP-27和Dodecapeptide為穩(wěn)定的多肽外,其他抗菌肽均為不穩(wěn)定多肽;BMAP-28和Dodecapeptide為疏水性多肽,BMAP-27、BMAP-34、Bac-4、Bac-5、Bac-7和Indolicidin為親水性多肽;BMAP-27和BMAP-28由α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲構(gòu)成,BMAP-34主要由α螺旋和β轉(zhuǎn)角構(gòu)成,Bac4、Bac7、Indolicidin和Dodecapeptide由無規(guī)則卷曲構(gòu)成,Bac5由β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲構(gòu)成;沒有信號(hào)肽、跨膜區(qū)和糖基化位點(diǎn),BMAP-27、BMAP-28和BMAP-34各存在1個(gè)絲氨酸的磷酸化位點(diǎn).根據(jù)分析結(jié)果推測(cè)牛源cathelicidin類抗菌肽可作用于細(xì)菌的細(xì)胞壁或細(xì)胞膜,進(jìn)而導(dǎo)致細(xì)菌死亡.

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