利用mtDNA D-loop區(qū)研究貴州豬種的遺傳多樣性與起源

作者:趙忠海; 周迪; 李輝; 易恒潔; 龍清孟; 師新彩; 卜小雁; 陳林; 楊華婷; 李興才 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院/高原山地動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室; 貴陽550025; 貴州省動物遺傳育種與繁殖重點實驗室; 貴陽550025; 貴州省遵義市畜牧站; 遵義563000; 貴州省正安縣畜牧產(chǎn)業(yè)發(fā)展辦公室; 遵義563400; 貴州省種畜禽種質(zhì)測定中心; 貴陽550018

摘要:線粒體DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)作為核外遺傳物質(zhì),承載著重要的遺傳信息,其Dloop區(qū)序列能反應(yīng)出物種的遺傳多樣性。為了對貴州豬(Sus scrofa domesticus)種的遺傳多樣性進(jìn)行評估,本研究選取了高坡豬、關(guān)嶺豬、從江香豬、黔南黑豬、黔北黑豬、柯樂豬、江口蘿卜豬、宗地花豬、白洗豬和糯谷豬共10個貴州省地方豬種與梅山豬、榮昌豬和大白豬3個外地品種作為研究對象,利用PCR擴增技術(shù)結(jié)合直接測序的方法對mtDNA的D-loop區(qū)全序列進(jìn)行擴增分析。結(jié)果顯示,實驗群體的mtDNA Dloop區(qū)全序列為1 117~1 148 bp,共12種長度的序列,除了宗地花豬的堿基組成差異較大,其他品種的堿基含量基本無差異,均表現(xiàn)為T的含量最高,C的含量最低,堿基A+T含量明顯高于C+G;在有效測序結(jié)果的149條拼接序列中發(fā)現(xiàn)66個多態(tài)位點,定義了16種單倍型,單倍型多樣性為0.421 5。分析高坡豬群體與其他豬種群體之間遺傳關(guān)系,發(fā)現(xiàn)其間基因交流較少,基因交流值(Nm)均小于1;高坡豬與宗地花豬之間的遺傳分化指數(shù)最高,遺傳分化指數(shù)(Fst)值為0.412 78,高坡豬與黔南黑豬和關(guān)嶺豬的遺傳分化指數(shù)較低,說明三者之間的遺傳關(guān)系較近。進(jìn)行品種間的遺傳多樣性分析時發(fā)現(xiàn),高坡豬與黔北黑豬親緣關(guān)系較近,而宗地花豬與其他12個品種的親緣關(guān)系都較遠(yuǎn)。綜合本研究結(jié)果可推測,目前10個貴州地方豬種的遺傳多樣性受到外來品種的影響。本研究為進(jìn)一步了解貴州豬種起源分化以及遺傳多樣性提供理論支持,并為地方豬種保護(hù)提供參考資料。

注:因版權(quán)方要求,不能公開全文,如需全文,請咨詢雜志社

農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報

北大期刊 下單

國際刊號:1674-7968

國內(nèi)刊號:11-3342/S

雜志詳情
相關(guān)熱門期刊

服務(wù)介紹LITERATURE

正規(guī)發(fā)表流程 全程指導(dǎo)

多年專注期刊服務(wù),熟悉發(fā)表政策,投稿全程指導(dǎo)。因為專注所以專業(yè)。

保障正刊 雙刊號

推薦期刊保障正刊,評職認(rèn)可,企業(yè)資質(zhì)合規(guī)可查。

用戶信息嚴(yán)格保密

誠信服務(wù),簽訂協(xié)議,嚴(yán)格保密用戶信息,提供正規(guī)票據(jù)。

不成功可退款

如果發(fā)表不成功可退款或轉(zhuǎn)刊。資金受第三方支付寶監(jiān)管,安全放心。