基于ITS的貴州省30個樹種的DNA條形碼研究
作者：成宇; 蔡莎莎; 舒劍鋒; 袁昊; 伍穎; 凃翠; 楊鵬; 趙財 貴州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 貴州貴陽550025
摘要：本文對貴州省19科26屬30種林木樹種植物ITS序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增及測序,用MEGA5.0軟件對序列進(jìn)行比對分析序列信息,用最近距離法計算種內(nèi)及種間遺傳距離,通過鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明,供試樹種的DNA總長度為506~684bp,其中平均G+C含量為64%,種內(nèi)平均遺傳距離為0.013,種間平均遺傳距離為0.236;基于ITS序列構(gòu)建的聚類樹顯示,對30種林木樹種的鑒定成功率為83%,因此,推薦ITS序列作為林木樹種DNA條形碼的候選序列。
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