摘要：為了快速區(qū)分長(zhǎng)江流域各水體中的鱭屬魚類,利用單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)標(biāo)記對(duì)短頜鱭(Coilia brachygnathus)、湖鱭(C. nasus taihuensis)和刀鱭(C. nasus)進(jìn)行物種鑒定。從120個(gè)在短頜鱭和刀鱭之間分化指數(shù)(Fst)為1的SNP位點(diǎn)中隨機(jī)挑選出20個(gè)用于引物設(shè)計(jì),從21個(gè)在湖鱭和刀鱭之間分化指數(shù)較高的SNP位點(diǎn)中隨機(jī)挑選出10個(gè)設(shè)計(jì)引物。隨機(jī)挑20尾短頜鱭、20尾湖鱭和12尾刀鱭用設(shè)計(jì)的引物擴(kuò)增、測(cè)序。結(jié)果表明:洞庭湖和鄱陽(yáng)湖的短頜鱭與刀鱭可以使用以上19個(gè)SNP分子標(biāo)記中的任何一個(gè)完全分開,剩下1個(gè)SNP標(biāo)記在所擴(kuò)增的樣本中沒有發(fā)現(xiàn)多樣性變異而被棄用。用于區(qū)分湖鱭與刀鱭的10個(gè)SNP分子標(biāo)記中有8個(gè)在所測(cè)樣本中可以擴(kuò)增并用于物種鑒定。其中單獨(dú)使用Ct-Cn_wtap位點(diǎn)時(shí),湖鱭和刀鱭的基因頻率相差最大,當(dāng)使用Ct-Cn_wtap和Ct-Cn_eif2b4位點(diǎn)時(shí),對(duì)湖鱭和刀鱭的鑒別準(zhǔn)確率可以達(dá)到100%。本研究提供了穩(wěn)定、高效和低成本識(shí)別短頜鱭和刀鱭、湖鱭和刀鱭的方法,為今后鱭屬魚類的物種鑒定和資源保護(hù)提供了有效的工具。