哈氏黃瓜NAC轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及低溫表達(dá)分析

作者:趙艷青; 杜建廠; 王盼喬; 秦曉東; 陳勁楓 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院; 南京210095; 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院種質(zhì)資源與生物技術(shù)研究所; 南京210014

摘要:以哈氏黃瓜(Cucumis sativus var. hardwickii)為試驗(yàn)材料,基于全基因組測序結(jié)果,利用生物信息學(xué)分析方法,鑒定獲得77個NAC轉(zhuǎn)錄因子,其結(jié)構(gòu)高度保守,序列長度在151~653個氨基酸之間,在7條染色體中呈非均勻分布;理論等電點(diǎn)在4.54~9.10之間;大部分轉(zhuǎn)錄因子定位在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)膜上;系統(tǒng)發(fā)生分析顯示所有NAC轉(zhuǎn)錄因子聚類為6個亞家族,其中亞家族Ⅲ序列結(jié)構(gòu)較為多樣性;進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)NAC轉(zhuǎn)錄因子存在片段重復(fù)和串聯(lián)重復(fù)等復(fù)制模式,沒有發(fā)生近代的全基因組復(fù)制事件,并在進(jìn)化過程中受到純化選擇作用;NAC轉(zhuǎn)錄因子基因在哈氏黃瓜幼苗根中表達(dá)量最高,其次為雌花和葉片;熒光定量分析發(fā)現(xiàn),低溫處理下,檢測的15個NAC基因中有12個顯著上調(diào)表達(dá),3個下調(diào)表達(dá),并存在一組表達(dá)量差異明顯的HdNAC32–Hd ANC47片段復(fù)制基因?qū)?。由此可知NAC轉(zhuǎn)錄因子在受低溫脅迫的哈氏黃瓜中發(fā)揮重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。

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