擬穴青蟹不同發(fā)育時期胚胎基因表達的內(nèi)參基因的篩選

作者:呂梁; 張子平; 萬海付; 孫玉龍; 王藝磊 集美大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院; 農(nóng)業(yè)部東海海水健康養(yǎng)殖重點實驗室; 福建廈門361021; 福建農(nóng)林大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院; 福建福州350002

摘要:為獲得適用于研究擬穴青蟹(Scylla paramamosain)不同發(fā)育時期胚胎基因表達的內(nèi)參基因,本研究采用 3 個內(nèi)參基因篩選軟件 geNorm、NormFinder 及 BestKeeper 對微管蛋白α1A(Tuba1a)、核糖體蛋白 L13(Rpl13)、泛素(UBQ)、核糖體蛋白 S6 激酶(Rps6)、精氨酸激酶(Ak)、3-磷酸甘油脫氫酶(gapdh)、28S 核糖體 RNA(28S)、18S 核糖體 RNA(18S)和延伸因子 1A基因(EF-1α)等 9個常用候選內(nèi)參基因在擬穴青蟹不同發(fā)育時期胚胎的表達穩(wěn)定性進行分析。geNorm 分析表明, EF-1α和 Rpl13 的表達穩(wěn)定性最高,并且采用 2 個內(nèi)參基因同時校正目標基因的定量結(jié)果可以達到最優(yōu)效果;NormFinder分析表明, gapdh和 EF-1α是 9個候選內(nèi)參基因中表達最穩(wěn)定的;BestKeeper分析表明, gapdh 的標準偏差和變異系數(shù)是 9 個候選基因中最低的。綜合 3 個內(nèi)參基因篩選軟件,可以選用 EF-1α,或選用 EF-1α和 gapdh 雙內(nèi)參同時校正擬穴青蟹不同胚胎發(fā)育時期各基因的表達情況。

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