莢蒾屬植物DNA條形碼鑒定

作者:吳田澤; 陳露; 肖煜強(qiáng); 鄒問汀; 胡心怡; 李宇陽; 劉霞; 黃升 武漢理工大學(xué)化學(xué)化工與生命科學(xué)學(xué)院; 湖北武漢430070; 湖北民族大學(xué)林學(xué)園藝學(xué)院; 湖北恩施445000; 恩施冬升植物開發(fā)有限責(zé)任公司; 湖北恩施445000

摘要:目的:通過分析13種莢蒾屬藥用植物的ITS2(internal transcribed spacer 2)條形碼序列,探討莢蒾屬植物屬內(nèi)鑒定的新方法,為莢蒾屬植物的快速、準(zhǔn)確、批量鑒定提供方法學(xué)依據(jù)。方法:該研究收集13種莢蒾屬植物共32份樣品,進(jìn)行基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增ITS2序列并測(cè)序。所得序列經(jīng)CodonCode Aligner拼接并剪切后,采用MEGA5.1軟件計(jì)算遺傳距離,比較種內(nèi)、種間序列差異,利用鄰接法(Neighbor-Joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)聚類樹。結(jié)果:基于ITS2序列分析,13種藥材種間存在明顯差異,各個(gè)種的種內(nèi)最大遺傳距離均小于種間最小遺傳距離;構(gòu)建的系統(tǒng)樹各個(gè)種不同樣本均分別聚在一起,表現(xiàn)出單系性。結(jié)論:ITS2序列作為DNA條形碼可較好地用于莢蒾屬植物的鑒定研究,有助于為莢蒾屬植物鑒定提供分子生物學(xué)方法基礎(chǔ),也為日后莢蒾屬植物的開發(fā)打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

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