小桐子ACO1基因的克隆與表達分析

作者:辛胡; 唐利洲; 付義; 蔣凱文; 楊蕾; 劉家奇; 馬楠; 田斌; 王海波 西南林業(yè)大學國家林業(yè)局西南地區(qū)生物多樣性保育重點實驗室; 云南昆明650224; 曲靖師范學院/云南高原生物資源保護與利用研究中心; 云南曲靖655011; 曲靖師范學院/云南省高校云貴高原動植物遺傳多樣性及生態(tài)適應性重點實驗室; 云南曲靖655011

摘要:為探討ACO1基因在小桐子抗逆中的作用,本研究基于小桐子最新注釋的基因組數據庫,首次克隆了小桐子ACO1基因的全長編碼框序列,命名為JcACO1,并對其功能結構域、系統(tǒng)進化、基因結構及器官和低溫表達特性進行了分析。結果表明,克隆的JcACO1基因全長為1022bp,編碼319個氨基酸,預測分子量為36.0kDa,等電點5.5。序列比對表明,小桐子JcACO1在序列中部保守性較高,具有1個Pcbc superfamily保守結構域。進化樹分析顯示,小桐子JcACO1基因與毛果楊、橡膠樹、木薯的同源性較高。qRT-PCR表達分析表明,小桐子幼苗JcACO1基因存在器官表達特異性,在葉與莖中表達量較高,而在根中表達量較低。另外,JcACO1基因在三種器官中都受低溫誘導,低溫脅迫24h時,基因在根與莖中表達量最大。說明JcACO1基因表達量升高,以響應小桐子的抗冷脅迫。

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