谷瘟病菌無(wú)毒基因AVR1-CO39序列變異及遺傳多樣性分析

作者:任世龍; 白輝; 王永芳; 全建章; 董志平; 李志勇; 邢繼紅 河北省農(nóng)林科學(xué)院谷子研究所河北省雜糧重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室國(guó)家谷子改良中心; 石家莊050035; 河北省植物生理與分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 保定071001

摘要:谷瘟病是谷子上毀滅性病害之一,為了探討不同地區(qū)谷瘟病菌群體的遺傳多樣性,對(duì)我國(guó)11個(gè)省(自治區(qū)) 171株谷瘟病菌的無(wú)毒基因AVR1-CO39進(jìn)行擴(kuò)增測(cè)序,并利用ClustalX2.0和DnaSP5.0軟件對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果表明,171株谷瘟病菌單孢菌株AVR1-CO39的CDS編碼區(qū)共有40個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),依據(jù)序列之間的核苷酸差異劃分為37個(gè)單倍型,H1型為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)單倍型。我國(guó)11個(gè)省份谷瘟病菌群體的AVR1-CO39具有較高的遺傳多態(tài)性,由于存在較為頻繁的基因交流,種群之間沒(méi)有明顯的遺傳分化。種群內(nèi)部的遺傳分化是谷瘟病菌遺傳分化的主要方式,錯(cuò)配分布檢測(cè)結(jié)果顯示進(jìn)化過(guò)程中可能出現(xiàn)群體擴(kuò)張,并且谷瘟病菌的聚類(lèi)與地理來(lái)源沒(méi)有顯著的關(guān)系。研究結(jié)果表明,谷瘟病菌無(wú)毒基因AVR1-CO39具有較高的變異性,以H1為核心單倍型在不斷地變異衍生出新的等位基因類(lèi)型,并且這種變異衍生趨勢(shì)并不受地理隔離的影響。研究結(jié)果可為谷子抗病品種選育,揭示谷瘟病菌無(wú)毒基因與谷子抗病基因之間的互作機(jī)制提供理論支持。

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